Kontenery występują w różnych rozmiarach, mają również inne właściwości, dlatego też do ich przewozu stosowane są specjalistyczne środki transportu. Takie środki zapewniają również szybki załadunek i wyładunek oraz bezpieczny przewóz załadunku. Wyróżnia się transport morski, kolejowy oraz samochodowy. W żegludze do przewozów kontenerów wykorzystywane są kontenerowce, semikontenerowce oraz rorowce. Kontenerowce do jednostki o załadunku pionowym najczęściej używane na liniach transkontynentalnych ja i w żegludze kabotażowej. Ich pojemność sięga od kilkudziesięciu do prawie 10 tysięcy TEU. Semikontenerowce, to statki częściowo przystosowane do przewozu kontenerów i głównie transportują drobnicę. Z kolei rorowce przewożą ładunki toczone, i głównie transportują same kontenery. Transport kolejowy polega na wykorzystaniu specjalnych wagonów kontenerowych i wagonów typu platformy. Są to jedynie stalowe konstrukcje, które nie mają ani ścian bocznych, ani dachu i podłogi. Kontenery mocowane są na nich za pomocą odpowiedniej liczby czopów. Ostatnia możliwością jest transport samochodowy. Kontenery po drogach przewożone są samochodami ciężarowymi zazwyczaj składającymi się z dwóch części, ciągnika siodłowego i naczepy kontenerowej.